143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5303 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 187 aa  362  1e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  73.8 
 
 		 186 aa  271  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  62.92 
 
 		 199 aa  205  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  58.15 
 
 		 188 aa  195  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 180 aa  112  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  33.54 
 
 		 207 aa  96.3  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1872  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 194 aa  90.5  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3251  regulatory protein, TetR  30 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000584066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1299  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.808118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2269  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  29.38 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3623  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4700  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804657  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 187 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000620531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0946  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1527  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3891  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.75762  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1196  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3138  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.293904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5846  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  37.5 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  37.5 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  37.5 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  27.52 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  32.68 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.246546 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3817  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.287238  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4888  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 188 aa  62  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4754  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 215 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000397464  hitchhiker  0.00227458 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3873  regulatory protein TetR  33.91 
 
 		 208 aa  62  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0086  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0095  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0333517 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 211 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0076  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4190  hypothetical protein  27.74 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4608  TetR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0802  regulatory protein, TetR  34.88 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334843  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0745  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4824  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.870424 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.20619 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4912  transcriptional regulator, TetR family  23.97 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.095587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0883  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6023  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 184 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620449  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2251  putative transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 187 aa  51.2  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0102  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3680  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 207 aa  48.9  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3415  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 207 aa  48.9  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5889  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 186 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2100  regulatory protein TetR  30.63 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726154  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3310  hypothetical protein  26.32 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.106528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5723  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 177 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00322286 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0051  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0191549  normal  0.55733 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  27.37 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  38.03 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  21.28 
 
 		 194 aa  45.4  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5162  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 193 aa  45.1  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.186575 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 175 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 209 aa  45.1  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4794  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1794  transcriptional regulator  41.1 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0417  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 183 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.137134 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4774  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 220 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0197844  hitchhiker  0.000543093 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 250 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0513  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.826847 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31550  transcriptional regulator  30.57 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0511  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5228  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 290 aa  42.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 307 aa  42.4  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  32.14 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>