82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4190 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4190  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  434  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2251  putative transcriptional regulator, TetR family  51.38 
 
 		 187 aa  176  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0095  TetR family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 205 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0333517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0086  TetR family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 205 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0076  TetR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0745  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0102  TetR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3891  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.75762  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6023  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620449  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 180 aa  62  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.246546 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5889  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3817  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.287238  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  32.23 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  27.14 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3873  regulatory protein TetR  32.5 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2100  regulatory protein TetR  30.21 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726154  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1299  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.808118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 179 aa  52  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 187 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.20619 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3251  regulatory protein, TetR  26.24 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000584066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  25.29 
 
 		 202 aa  48.1  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  31.37 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  31.37 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  31.37 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000620531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  40.26 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 199 aa  45.8  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4608  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 182 aa  45.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 214 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0883  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  29.1 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 310 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  23.02 
 
 		 308 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0802  regulatory protein, TetR  28.35 
 
 		 182 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334843  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3794  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.549336  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  31.65 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3867  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0211824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3816  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0181155  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5846  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  26.67 
 
 		 189 aa  42.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  22.88 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  29.31 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 225 aa  42.4  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 198 aa  42.4  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  27.91 
 
 		 204 aa  42.4  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 212 aa  42  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 213 aa  42  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 250 aa  42  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 257 aa  42  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 192 aa  41.6  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 205 aa  41.6  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 237 aa  41.6  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  35.62 
 
 		 209 aa  41.6  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>