111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2251 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2251  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 187 aa  379  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4190  hypothetical protein  51.38 
 
 		 215 aa  176  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0102  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0086  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0095  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 205 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0333517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0076  TetR family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 205 aa  140  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0745  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 188 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3891  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.75762  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 180 aa  67.8  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 238 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  32.05 
 
 		 238 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 238 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  32.05 
 
 		 238 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  32.05 
 
 		 238 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 238 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.20619 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0946  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3817  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.287238  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5889  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3873  regulatory protein TetR  29.19 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6023  transcriptional regulator, TetR family  24.82 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620449  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1299  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.808118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0883  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4608  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0802  regulatory protein, TetR  30.47 
 
 		 182 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334843  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2100  regulatory protein TetR  31.11 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726154  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  27.78 
 
 		 207 aa  52  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 179 aa  51.6  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 187 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.246546 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  28.8 
 
 		 198 aa  50.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  26.92 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1196  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 214 aa  47.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4888  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  25.41 
 
 		 287 aa  47.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1242  transcriptional regulator, TetR-family  32.91 
 
 		 190 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  32.89 
 
 		 202 aa  45.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 224 aa  45.4  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 214 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 178 aa  45.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 209 aa  44.7  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 200 aa  44.7  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000620531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 214 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  29.76 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 236 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 257 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 237 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2269  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 213 aa  42.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 308 aa  42.4  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 212 aa  42.4  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 193 aa  42.4  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 202 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  30.3 
 
 		 196 aa  42.4  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 202 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 206 aa  42.4  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  20 
 
 		 214 aa  42.4  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 210 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 205 aa  42  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 211 aa  42  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4754  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 215 aa  42  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000397464  hitchhiker  0.00227458 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 231 aa  41.6  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  30.47 
 
 		 210 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 141 aa  42  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 202 aa  41.6  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2963  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 196 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.08395  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 201 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 201 aa  41.6  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  30.49 
 
 		 202 aa  41.6  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2004  regulatory protein TetR  31.58 
 
 		 216 aa  41.6  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 212 aa  41.2  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4912  transcriptional regulator, TetR family  23.03 
 
 		 209 aa  41.2  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.095587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2970  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 196 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.642297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>