255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5846 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5846  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  400  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 177 aa  99.4  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 179 aa  97.4  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0883  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 185 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  35.33 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 188 aa  89.4  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 192 aa  88.6  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000620531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  30.65 
 
 		 189 aa  87.8  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1196  TetR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4888  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 209 aa  85.9  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4608  TetR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 182 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0802  regulatory protein, TetR  35.58 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334843  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3251  regulatory protein, TetR  34.91 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000584066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3623  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3680  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1299  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.808118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4700  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804657  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3415  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4754  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000397464  hitchhiker  0.00227458 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  37.01 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 187 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  48.72 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1872  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0946  TetR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.246546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 211 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  31.65 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3891  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.75762  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2269  transcriptional regulator, TetR family  43.9 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3873  regulatory protein TetR  40.16 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  32.91 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4912  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.095587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0086  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0095  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0333517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0076  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  38.39 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  38.39 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3310  hypothetical protein  32.28 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.106528 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  38.39 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4824  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.870424 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3817  TetR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.287238  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 187 aa  62  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.20619 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2100  regulatory protein TetR  30.65 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726154  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0745  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1527  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0102  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5881  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6023  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 184 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620449  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.82 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4190  hypothetical protein  30 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  31.82 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.82 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.82 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.82 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.82 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  31.82 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 212 aa  48.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 202 aa  48.5  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2792  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 190 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.82 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3711  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 420 aa  47.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4596  regulatory protein TetR  28.24 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1059  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3625  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.99 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1594  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000148614  unclonable  0.000000209189 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3138  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.293904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  25.3 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 238 aa  46.2  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>