More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4774 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4774  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 220 aa  435  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0197844  hitchhiker  0.000543093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  75.52 
 
 		 188 aa  210  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1442  transcriptional regulator, TetR family  52.03 
 
 		 167 aa  151  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  44.97 
 
 		 213 aa  138  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  46.82 
 
 		 183 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1652  transcriptional regulator, TetR family  51.57 
 
 		 196 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5465  putative transcriptional regulator, TetR family  51.39 
 
 		 195 aa  118  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0907428 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1216  transcriptional regulator, TetR family  52.6 
 
 		 224 aa  118  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187428 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  41.92 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3293  regulatory protein TetR  41.27 
 
 		 208 aa  116  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147599  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34410  transcriptional regulator  40 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38267  normal  0.633613 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  52.34 
 
 		 205 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6821  TetR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  55.73 
 
 		 198 aa  109  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4018  TetR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 216 aa  106  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0721  transcriptional regulator, TetR family  45.58 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1571  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.538568  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3809  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 224 aa  99.8  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3360  regulatory protein, TetR  51.45 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.683642  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13072  TetR family transcriptional regulator  45.06 
 
 		 204 aa  92  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.483288 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  49.56 
 
 		 230 aa  89.4  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3680  TetR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 195 aa  88.6  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2038  TetR family transcriptional regulator  57.01 
 
 		 208 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1813  TetR family transcriptional regulator  46.95 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1860  TetR family transcriptional regulator  46.95 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.237436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1794  TetR family transcriptional regulator  46.95 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0486458  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4309  TetR family transcriptional regulator  43.83 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3019  transcriptional regulator, TetR family  41.72 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.190372  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3691  TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.811225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4837  transcriptional regulator, TetR family  40.78 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000934905  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  44.19 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  55.22 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  37.27 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  48.91 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2654  regulatory protein TetR  51.85 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  52.17 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2600  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 185 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  50.72 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2774  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0349028  normal  0.98242 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3865  transcriptional regulator, TetR family protein  35.34 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  40.21 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  45.68 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  53.03 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  36.19 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  40.21 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  37.72 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  36.79 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  54.39 
 
 		 173 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5421  TetR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 182 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.211014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  54.72 
 
 		 179 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 174 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  34.83 
 
 		 190 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  48.53 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0474  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  36.89 
 
 		 238 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 197 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4014  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 238 aa  53.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  28.68 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5881  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  37.11 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2615  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 199 aa  53.5  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>