66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4824 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4824  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 209 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.870424 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4912  transcriptional regulator, TetR family  91.83 
 
 		 209 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.095587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4888  TetR family transcriptional regulator  75.74 
 
 		 209 aa  329  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4754  TetR family transcriptional regulator  62.76 
 
 		 215 aa  269  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000397464  hitchhiker  0.00227458 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1196  TetR family transcriptional regulator  57 
 
 		 214 aa  240  1e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3680  TetR family transcriptional regulator  56.1 
 
 		 207 aa  215  4e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3415  TetR family transcriptional regulator  56.1 
 
 		 207 aa  215  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3310  hypothetical protein  52.63 
 
 		 212 aa  206  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.106528 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3138  TetR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 207 aa  174  8e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.293904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1527  TetR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 204 aa  172  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 231 aa  150  8.999999999999999e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0944  TetR family transcriptional regulator  54.47 
 
 		 123 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.335834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0946  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 206 aa  102  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1299  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 202 aa  97.8  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.808118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 192 aa  80.9  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000620531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  29.48 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2269  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3251  regulatory protein, TetR  30.72 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000584066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1872  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  27.33 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  27.78 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.246546 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4700  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804657  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3623  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.20619 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5846  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0883  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0802  regulatory protein, TetR  24.73 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334843  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4608  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  26.88 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 199 aa  52  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6023  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 184 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620449  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 184 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3891  TetR family transcriptional regulator  21.89 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.75762  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 188 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2100  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726154  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  26.62 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  26.62 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  26.62 
 
 		 238 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 202 aa  45.4  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3817  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 209 aa  45.1  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.287238  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2004  regulatory protein TetR  30.26 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.84069  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3301  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 193 aa  41.6  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664283 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  29.58 
 
 		 221 aa  41.6  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2251  putative transcriptional regulator, TetR family  23.35 
 
 		 187 aa  41.2  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>