281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_42260 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  100 
 
 		 198 aa  400  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3251  regulatory protein, TetR  43.02 
 
 		 205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000584066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4700  transcriptional regulator, TetR family  43.68 
 
 		 217 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804657  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3623  transcriptional regulator, TetR family  43.68 
 
 		 217 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0946  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  33.54 
 
 		 207 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 177 aa  97.1  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 188 aa  97.1  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000620531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1872  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 194 aa  95.1  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 231 aa  94.7  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1299  TetR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 202 aa  94  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.808118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2269  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 197 aa  89  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0883  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 185 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4888  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 224 aa  85.9  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 180 aa  85.1  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 199 aa  85.1  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3310  hypothetical protein  29.73 
 
 		 212 aa  84.3  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.106528 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1527  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1196  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5846  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  26.49 
 
 		 189 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4824  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.870424 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4912  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.095587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3680  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3415  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4608  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4754  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000397464  hitchhiker  0.00227458 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6023  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620449  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  32.67 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0802  regulatory protein, TetR  31.54 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334843  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3138  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.293904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  44.05 
 
 		 184 aa  71.2  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3891  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.75762  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 180 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.246546 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  37.61 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  37.61 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  37.61 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3817  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.287238  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  28.68 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0745  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2100  regulatory protein TetR  29.61 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726154  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3873  regulatory protein TetR  28.16 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.20619 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4190  hypothetical protein  27.14 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0086  TetR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0095  TetR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0333517 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2251  putative transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0076  TetR family transcriptional regulator  23.42 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6064  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  21 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0102  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 188 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1515  regulatory protein, TetR  31.87 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4724  regulatory protein, TetR  42.31 
 
 		 191 aa  48.5  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  24.34 
 
 		 192 aa  48.1  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 189 aa  48.1  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 189 aa  48.1  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0144  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 221 aa  46.6  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  26.67 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1329  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0421  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 189 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0114693  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 305 aa  45.8  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0195  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.5282  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>