76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4912 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4912  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 209 aa  431  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.095587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4824  transcriptional regulator, TetR family  91.83 
 
 		 209 aa  401  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.870424 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4888  TetR family transcriptional regulator  74.75 
 
 		 209 aa  326  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4754  TetR family transcriptional regulator  62.76 
 
 		 215 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000397464  hitchhiker  0.00227458 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1196  TetR family transcriptional regulator  56.04 
 
 		 214 aa  239  2.9999999999999997e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3415  TetR family transcriptional regulator  55.61 
 
 		 207 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3680  TetR family transcriptional regulator  55.61 
 
 		 207 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3310  hypothetical protein  52.68 
 
 		 212 aa  205  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.106528 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1527  TetR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 204 aa  178  5.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3138  TetR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 207 aa  175  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.293904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 224 aa  158  6e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 231 aa  154  6e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0944  TetR family transcriptional regulator  52.85 
 
 		 123 aa  128  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.335834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0946  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 206 aa  106  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1299  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.808118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 192 aa  84.7  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000620531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 180 aa  80.9  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  28.3 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2269  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 197 aa  77.8  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3251  regulatory protein, TetR  30.12 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000584066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1872  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 177 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  28.47 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 180 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.246546 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  27.33 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4700  transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804657  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3623  transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0883  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5846  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0802  regulatory protein, TetR  25.82 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334843  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.20619 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  26.58 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4608  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6023  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 184 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620449  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  25.66 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2100  regulatory protein TetR  26.44 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726154  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 188 aa  48.5  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3891  TetR family transcriptional regulator  21.39 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.75762  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3817  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.287238  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 238 aa  45.4  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 238 aa  45.4  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  26.62 
 
 		 238 aa  45.1  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  26.62 
 
 		 238 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 238 aa  45.4  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  26.62 
 
 		 238 aa  45.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  47.92 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3103  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 185 aa  42  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  30.99 
 
 		 221 aa  42  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  24.59 
 
 		 219 aa  42  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 231 aa  41.6  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2251  putative transcriptional regulator, TetR family  23.03 
 
 		 187 aa  41.2  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
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