86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3891 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3891  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  424  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.75762  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0076  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0095  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0333517 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0086  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 186 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.20619 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2251  putative transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4190  hypothetical protein  31.91 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 187 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0102  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  28.46 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0946  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 206 aa  69.3  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3817  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.287238  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5846  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0745  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2100  regulatory protein TetR  37.01 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726154  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4608  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 182 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0883  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  32.14 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  31.32 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  31.32 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0802  regulatory protein, TetR  29.3 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334843  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  30.38 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3873  regulatory protein TetR  30.38 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  28.68 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  32.31 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2269  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6023  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1527  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4754  TetR family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000397464  hitchhiker  0.00227458 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3251  regulatory protein, TetR  25 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000584066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.246546 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  31.43 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1299  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.808118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000620531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4888  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3623  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4700  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804657  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4824  transcriptional regulator, TetR family  21.89 
 
 		 209 aa  48.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.870424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5881  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4912  transcriptional regulator, TetR family  21.39 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.095587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1872  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5889  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 186 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 193 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 196 aa  45.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 236 aa  45.4  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 198 aa  45.1  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1196  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4262  TetR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1135  putative transcriptional regulator  32.89 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12440  AcrR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 211 aa  42.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  33.93 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1058  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 205 aa  41.6  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
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NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  29.87 
 
 		 234 aa  41.2  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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