106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3960 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 210 aa  404  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3817  TetR family transcriptional regulator  90.32 
 
 		 209 aa  327  8e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.287238  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3873  regulatory protein TetR  79.05 
 
 		 208 aa  303  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6023  transcriptional regulator, TetR family  40.4 
 
 		 184 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620449  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 238 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  37.85 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 238 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  37.85 
 
 		 238 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  37.85 
 
 		 238 aa  87.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 238 aa  87.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 180 aa  79  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.20619 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.246546 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  41.09 
 
 		 188 aa  73.6  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0802  regulatory protein, TetR  34.93 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334843  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4608  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3891  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.75762  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0883  transcriptional regulator, TetR family  36.64 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1299  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.808118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3251  regulatory protein, TetR  34.68 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000584066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  35.37 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000620531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0102  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.508709  normal  0.486637 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 211 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0076  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 205 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.548175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0745  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 188 aa  62  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1527  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 204 aa  62  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0086  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0095  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0333517 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 188 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  32.31 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4700  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804657  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3623  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1872  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0946  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  28.68 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4754  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000397464  hitchhiker  0.00227458 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3138  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.293904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5846  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4190  hypothetical protein  32.23 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2251  putative transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1196  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5889  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 186 aa  52  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  28.38 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0020  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 246 aa  50.8  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.390674  normal  0.0209926 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4888  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4912  transcriptional regulator, TetR family  25.66 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.095587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4824  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 209 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.870424 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 214 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2100  regulatory protein TetR  46.81 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726154  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 307 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2575  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.230257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 194 aa  45.4  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 227 aa  45.4  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  34.85 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1816  TetR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.41828  normal  0.136235 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  39.62 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 213 aa  42.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4581  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 453 aa  42.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0520678  hitchhiker  0.00576912 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1181  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000866899  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 197 aa  42.4  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 186 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  35.71 
 
 		 219 aa  42  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 212 aa  42  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>