72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3680 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3415  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3680  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  412  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3310  hypothetical protein  84.39 
 
 		 212 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.106528 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1196  TetR family transcriptional regulator  71.07 
 
 		 214 aa  278  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4888  TetR family transcriptional regulator  56.44 
 
 		 209 aa  229  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4912  transcriptional regulator, TetR family  55.61 
 
 		 209 aa  226  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.095587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4824  transcriptional regulator, TetR family  56.1 
 
 		 209 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.870424 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4754  TetR family transcriptional regulator  51.98 
 
 		 215 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000397464  hitchhiker  0.00227458 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0944  TetR family transcriptional regulator  75.21 
 
 		 123 aa  176  3e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.335834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 231 aa  146  2.0000000000000003e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3138  TetR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 207 aa  141  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.293904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3681  TetR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.966495  normal  0.60312 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1527  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0946  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.826877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42260  TetR family regulatory protein  29.73 
 
 		 198 aa  87  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5846  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2407  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0993242  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2981  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.341172 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3251  regulatory protein, TetR  31.33 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000584066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1596  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000620531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1901  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4700  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.804657  normal  0.0108792 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3623  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1872  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 194 aa  73.6  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  30.07 
 
 		 189 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1299  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.808118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  28.76 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1421  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2269  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1565  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5294  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0307229 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0883  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.476269  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1619  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4460  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.20619 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1595  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.201593  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2100  regulatory protein TetR  30.67 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.726154  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2656  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 179 aa  58.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754114  normal  0.0141418 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4608  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5303  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398356  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1468  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 186 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.781673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0513  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 188 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0301  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 180 aa  52  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.246546 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0802  regulatory protein, TetR  28.75 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334843  normal  0.796776 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  25.95 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5117  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5206  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5497  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  25.49 
 
 		 199 aa  48.5  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2657  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 202 aa  48.5  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.613192  normal  0.699424 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0745  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 188 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5605  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 184 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3873  regulatory protein TetR  33.06 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3817  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.287238  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3891  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.75762  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3960  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.879503  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1527  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764991  normal  0.0248923 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6023  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 184 aa  43.5  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620449  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1007  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 238 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.85068  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0354  hypothetical protein  34.18 
 
 		 230 aa  42.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0313675 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1312  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 238 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1726  transcriptional regulator, TetR family protein  31.53 
 
 		 238 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0513672  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1810  transcriptional regulator, TetR family protein  31.53 
 
 		 238 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.976243  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0284  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 238 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0846937  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0282  TetR family regulatory protein  31.53 
 
 		 238 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381975  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 206 aa  42  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 200 aa  42  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2251  putative transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 187 aa  41.2  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>