174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1527 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1527  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 209 aa  407  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764991  normal  0.0248923 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  41.28 
 
 		 220 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  33.95 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0346  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0026  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.348467  normal  0.209562 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1743  transcriptional regulator, TetR family  25.31 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  38.27 
 
 		 250 aa  52.4  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 181 aa  51.2  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2385  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 176 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000106592  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2721  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 194 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5083  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3310  hypothetical protein  48 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.106528 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0326  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 263 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4249  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 191 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.399807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  21.18 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2324  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 240 aa  46.2  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3866  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 230 aa  45.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599707  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 193 aa  46.2  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  29.63 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3088  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 235 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3148  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 235 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3108  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 235 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 225 aa  45.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 182 aa  45.8  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 195 aa  45.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 195 aa  45.4  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  25.17 
 
 		 195 aa  45.4  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  25.17 
 
 		 195 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2241  TetR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 198 aa  45.4  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7288  hitchhiker  0.000000000000408452 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 195 aa  45.4  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0392  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.022112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4608  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 206 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.198377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 195 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2097  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 186 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191848  normal  0.237667 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 195 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 195 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4869  regulatory protein, TetR  35.96 
 
 		 224 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 210 aa  45.1  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4837  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 237 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4925  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 237 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.733021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  38.89 
 
 		 191 aa  45.1  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1320  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 224 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 195 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 199 aa  45.1  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2583  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 226 aa  45.1  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1826  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 250 aa  45.1  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0995188  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 205 aa  45.1  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 193 aa  45.1  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0853  regulatory protein TetR  40.32 
 
 		 223 aa  45.1  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137644  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5311  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 210 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 199 aa  45.1  0.0009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4737  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 224 aa  45.1  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 218 aa  45.1  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 229 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2951  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777364 
 
 
-
 
NC_003296  RS03014  putative transcription regulator protein  33.7 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3680  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3035  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  40.74 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3415  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6871  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.0580493 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2790  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.765768  normal  0.318997 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3290  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3627  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 261 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1914  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2516  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  24.51 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2533  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 252 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3572  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0354  hypothetical protein  36.73 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0313675 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3937  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00797355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0267  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.700682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3988  regulatory protein, TetR  30.12 
 
 		 233 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.100564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>