94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3627 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3627  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 261 aa  542  1e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4177  TetR family transcriptional regulator  69.57 
 
 		 254 aa  384  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.526119 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0326  TetR family transcriptional regulator  53.11 
 
 		 263 aa  279  3e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2533  TetR family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 252 aa  278  8e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0298  TetR family transcriptional regulator  51.87 
 
 		 267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.985491  normal  0.0279616 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1415  TetR family transcriptional regulator  50.39 
 
 		 260 aa  270  2e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4183  TetR family transcriptional regulator  53.02 
 
 		 263 aa  269  4e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.302127 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0277  TetR family transcriptional regulator  49.79 
 
 		 261 aa  266  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00084176 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0354  hypothetical protein  31.03 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0313675 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3866  TetR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599707  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0233  hypothetical protein  26.8 
 
 		 246 aa  62  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3998  hypothetical protein  40.68 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.13761 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4025  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 221 aa  54.7  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1609  transcriptional regulator, TetR family  22.73 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 230 aa  49.3  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 202 aa  49.3  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 212 aa  48.9  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  27.72 
 
 		 202 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 201 aa  47.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 242 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1842  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 226 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1889  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 226 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1823  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 226 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 218 aa  46.2  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 234 aa  45.8  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 197 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0509  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 191 aa  45.8  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0855  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 244 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 195 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  23.64 
 
 		 209 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 228 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 228 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 228 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  38.18 
 
 		 258 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 195 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1527  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764991  normal  0.0248923 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 219 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  36.54 
 
 		 221 aa  44.3  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3161  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 218 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  21.98 
 
 		 194 aa  43.9  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 243 aa  43.9  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 212 aa  43.5  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 203 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  23.03 
 
 		 222 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0792  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 212 aa  43.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 221 aa  43.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 198 aa  43.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 220 aa  43.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 216 aa  42.7  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 412 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 195 aa  42.7  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1382  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 241 aa  42.7  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0100297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  37.74 
 
 		 192 aa  42.7  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 235 aa  42.7  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  25.76 
 
 		 217 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 412 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 206 aa  42.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  25.76 
 
 		 217 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  23.62 
 
 		 226 aa  42.7  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 412 aa  42.7  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 217 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 206 aa  42.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  25.76 
 
 		 217 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  25.76 
 
 		 217 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 229 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 226 aa  42.4  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 194 aa  42.7  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  21.71 
 
 		 213 aa  42.4  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 212 aa  42  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 217 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 216 aa  42  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 217 aa  42  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 497 aa  42  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 197 aa  42  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 203 aa  42  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 227 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 223 aa  42  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>