More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2516 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_2516  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 188 aa  375  1e-103  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1240  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  45.68 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5813  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 243 aa  65.1  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393234  hitchhiker  0.00386056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 212 aa  64.3  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  36.59 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0096  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 202 aa  59.7  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  26.76 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 226 aa  57.8  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 202 aa  57.8  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  41.18 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3419  transcription regulation protein  27.14 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.909274  normal  0.462694 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  35.16 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  23.98 
 
 		 242 aa  54.7  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 239 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 231 aa  53.9  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  26.25 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 269 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0940  transcriptional regulator  33.98 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00130273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 424 aa  53.9  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0939  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  25.68 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 244 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  21.71 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 209 aa  53.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3319  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  24.68 
 
 		 287 aa  52.8  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 242 aa  52.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  22.51 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 218 aa  52.4  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  21.91 
 
 		 228 aa  52.4  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  34.62 
 
 		 250 aa  52.4  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  21.89 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 193 aa  52.4  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 216 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  30.09 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  22.68 
 
 		 221 aa  52  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 223 aa  52  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 184 aa  51.6  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 210 aa  51.6  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0510  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 222 aa  51.6  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.673095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46570  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161907  hitchhiker  0.00000116969 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  21.99 
 
 		 324 aa  52  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4900  transcriptional regulator, TetR family  23.83 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.909356  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 234 aa  51.6  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5516  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 270 aa  51.2  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  33.73 
 
 		 205 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  25.18 
 
 		 201 aa  51.2  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 235 aa  51.2  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1470  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 213 aa  51.2  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.772741  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>