More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4869 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4869  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 224 aa  448  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5311  transcriptional regulator, TetR family  98.57 
 
 		 210 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5409  TetR family transcriptional regulator  83.65 
 
 		 208 aa  344  6e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394363  hitchhiker  0.00700115 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0267  TetR family transcriptional regulator  78.47 
 
 		 211 aa  329  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.700682  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0242  TetR family transcriptional regulator  76.08 
 
 		 210 aa  321  4e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0183309 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0257  TetR family transcriptional regulator  76.08 
 
 		 210 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0562904  normal  0.0230468 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0339  TetR family transcriptional regulator  76.92 
 
 		 213 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.736532 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4970  TetR family transcriptional regulator  77.88 
 
 		 208 aa  301  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0217357 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0385  transcriptional regulator AguR  70.79 
 
 		 211 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03840  transcriptional regulator AguR  69.8 
 
 		 221 aa  288  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0249  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3257  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255027  decreased coverage  0.000226088 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2249  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.672555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3239  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.727709  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4616  TetR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4356  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 210 aa  85.1  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1652  TetR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4626  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.468932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1329  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 246 aa  65.1  0.0000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000000704239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1044  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000181846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  27.27 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1981  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.992174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  27.4 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  38.27 
 
 		 264 aa  52.8  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 254 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 229 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5773  transcriptional regulator TetR family  40.62 
 
 		 208 aa  52  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 238 aa  51.6  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3865  transcriptional regulator, TetR family protein  41.27 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 245 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1790  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.305772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 241 aa  50.1  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1809  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1856  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  37.33 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 208 aa  49.3  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 206 aa  48.9  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 235 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 125 aa  48.9  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1515  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 219 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 218 aa  48.5  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 190 aa  48.5  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 234 aa  48.5  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1711  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.418522  normal  0.678609 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4061  TetR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  34.67 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 74 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  35.71 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  35.71 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 203 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0532  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0875801  normal  0.0277044 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0857  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.999415 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 248 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 212 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  30.91 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3200  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0829  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  37.5 
 
 		 225 aa  46.6  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2515  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.745235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2016  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 194 aa  46.2  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3809  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1842  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1889  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>