234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1914 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1914  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 205 aa  404  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2290  transcriptional regulator, TetR family  43.96 
 
 		 208 aa  135  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0794358  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 206 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0114  hypothetical protein  57.14 
 
 		 111 aa  112  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0121642  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  34.98 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  34.3 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0039  transcriptional regulator, TetR family  34.47 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1950  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663338  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2079  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.674297  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4596  regulatory protein TetR  39.45 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4996  transcriptional regulator  26.42 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4968  transcriptional regulator, TetR family domain protein  26.7 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22560  transcriptional regulator, tetR family  31.63 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0880115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1470  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.772741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  23.47 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2002  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0595533  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  23.35 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 216 aa  53.9  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  28.57 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4623  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 213 aa  52  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317667  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 227 aa  51.6  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17920  transcriptional regulator, tetR family  28.43 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.330701  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  43.48 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0708  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 244 aa  49.3  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  25.49 
 
 		 278 aa  48.9  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  35.85 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  25.85 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6157  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 190 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 195 aa  48.1  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6450  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 220 aa  48.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 195 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  38.03 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  26.21 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  26.21 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 233 aa  46.6  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0291  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  21.47 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 195 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3513  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809024  normal  0.394338 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3566  regulatory protein TetR  28.86 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 317 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0611  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 248 aa  45.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0425  transcriptional regulator, TetR family  22.6 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 235 aa  45.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  31.45 
 
 		 230 aa  45.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  26.74 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>