More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3088 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3088  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3108  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3148  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 213 aa  151  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0077  TetR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 211 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0087  TetR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0096  TetR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0589326 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0744  TetR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 280 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0103  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 187 aa  121  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.245867 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5533  transcriptional regulator, TetR family  26.76 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.374337  normal  0.0421471 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  27.16 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1818  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.671958  normal  0.199135 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0185  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.141931  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 204 aa  55.1  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 202 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  22.61 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 243 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  22.09 
 
 		 202 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1788  regulatory protein TetR  36.56 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5253  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 259 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3905  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 208 aa  53.5  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  29.91 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 258 aa  52.4  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 212 aa  52.8  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3875  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 217 aa  52.8  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.417982  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1121  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.2139 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  22.61 
 
 		 248 aa  52.4  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 213 aa  52.4  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 248 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  22.62 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2165  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.483923  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  22.62 
 
 		 196 aa  51.6  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  22.62 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  22.62 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  25.37 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  22.62 
 
 		 196 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  22.62 
 
 		 192 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  22.73 
 
 		 193 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1460  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  35.09 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  22.62 
 
 		 195 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  22.62 
 
 		 192 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 256 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_004310  BR0290  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547414  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 234 aa  50.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  22.45 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1071  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 240 aa  49.7  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  26.14 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0537  putative transcriptional regulator  36.23 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.664064  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 275 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05660  putative transcriptional regulator  36.23 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0304  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661097  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 201 aa  49.7  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3662  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  28.46 
 
 		 200 aa  49.7  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3735  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  0.477586 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>