200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3866 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3866  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  478  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599707  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0354  hypothetical protein  76.86 
 
 		 230 aa  371  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0313675 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0233  hypothetical protein  24.09 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4183  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 263 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.302127 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0326  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 263 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0277  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00084176 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1415  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0298  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 267 aa  71.6  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.985491  normal  0.0279616 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2533  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3627  TetR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4177  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.526119 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3998  hypothetical protein  26 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.13761 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4025  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003710  transcriptional regulator  26.32 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.485423  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 208 aa  52  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1882  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 137 aa  48.9  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0571882 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 210 aa  48.9  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 210 aa  48.9  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 209 aa  48.9  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1480  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 235 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  40.85 
 
 		 258 aa  48.5  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1502  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 235 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1477  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 238 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  36.36 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13891  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2756  hypothetical protein  42.31 
 
 		 137 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0928173 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1823  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 137 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000376424  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0855  transcriptional regulator, TetR family  26.91 
 
 		 244 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 286 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 191 aa  46.6  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 238 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2703  regulatory protein TetR  33.82 
 
 		 182 aa  46.6  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0410158  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 195 aa  46.2  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  29.27 
 
 		 209 aa  46.2  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  38.46 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  28.08 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 236 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 257 aa  45.4  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1527  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 209 aa  45.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.764991  normal  0.0248923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 199 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0703  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 216 aa  45.4  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 206 aa  45.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 497 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 218 aa  45.4  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 234 aa  45.4  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 210 aa  45.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 212 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 218 aa  45.4  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  34.29 
 
 		 254 aa  45.1  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 204 aa  45.4  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 291 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  32 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1938  hypothetical protein  32 
 
 		 186 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4186  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 195 aa  45.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 438 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 197 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  31.46 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 195 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1826  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 250 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0995188  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1320  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2087  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0227018  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5684  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000982546 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2324  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 240 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3997  hypothetical protein  29.23 
 
 		 250 aa  43.5  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.435374 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  40.74 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1712  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149018  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 173 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3384  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 193 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>