145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1712 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1712  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  469  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149018  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3427  transcriptional regulator, TetR family  27.2 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5237  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1945  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4417  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3682  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 540 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0191871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 210 aa  52.4  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5582  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 218 aa  52  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2537  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  38.96 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 209 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 192 aa  48.9  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  26.57 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 236 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3271  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 201 aa  48.9  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377871  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 191 aa  48.9  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 210 aa  48.9  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 192 aa  48.5  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 259 aa  47.8  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1993  transcriptional regulator, TetR family  24.2 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 245 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  39.29 
 
 		 182 aa  47  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 213 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 221 aa  47  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 215 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4851  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 194 aa  46.2  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 200 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4046  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 222 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3455  transcriptional regulator, TetR family  28.69 
 
 		 245 aa  46.6  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 183 aa  45.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 200 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 236 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 207 aa  45.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2237  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 228 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 222 aa  45.1  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 211 aa  45.1  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  35.09 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 304 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4695  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35780  TetR family regulatory protein  32.58 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  27.52 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2444  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 217 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1442  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 167 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  40 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6530  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.051486 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 191 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 189 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  37.7 
 
 		 218 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 191 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 191 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 208 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3866  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 230 aa  43.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599707  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 199 aa  43.5  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0256  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.968825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  37.7 
 
 		 209 aa  42.7  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 204 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 259 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3896  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 211 aa  43.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3394  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 220 aa  43.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222962 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  24.35 
 
 		 224 aa  43.1  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>