More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0038 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  377  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  377  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  98.43 
 
 		 191 aa  370  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  62.64 
 
 		 191 aa  219  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  61.62 
 
 		 191 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  39.46 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 237 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  37.95 
 
 		 202 aa  91.3  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 207 aa  91.3  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  35.96 
 
 		 204 aa  90.5  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 199 aa  87.8  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  38.06 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 209 aa  85.1  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  39.82 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  33.74 
 
 		 205 aa  81.3  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 199 aa  77.8  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  43.81 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 248 aa  72  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 205 aa  70.9  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  49.41 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  32.66 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12090  transcriptional regulator, tetR family  37.31 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  38.61 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5887  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.350094 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  38.58 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  44.21 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  40.86 
 
 		 214 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  50.85 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 383 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3001  transcriptional regulator, TetR family  38.26 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 201 aa  62  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3026  transcriptional regulator, putative  30.32 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.127274  normal  0.152535 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  39.06 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  61.22 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  32.92 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4786  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  40.22 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2385  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000106592  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  39.09 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  37.11 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4304  TetR family transcriptional regulator  39 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.127399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2283  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000000171234  hitchhiker  0.000491617 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1006  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.217455  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4074  TetR family transcriptional regulator  39 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  36.55 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4150  TetR family transcriptional regulator  39 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2120  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.613447  normal  0.0993721 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3160  transcriptional regulator, putative  30.32 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0108534  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  54.39 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  34.57 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4851  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>