More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3625 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  100 
 
 		 191 aa  388  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  32.74 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0939  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2481  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0309  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.312076  normal  0.149076 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 497 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3300  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5104  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  31.67 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 247 aa  54.7  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013174  Jden_2540  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.34282 
 
 
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NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_0368  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 184 aa  54.3  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00011837  normal  0.0425 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
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NC_004116  SAG0258  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.569121  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_0822  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.752802  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
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NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 222 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3907  regulatory protein TetR  48.89 
 
 		 212 aa  53.9  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
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NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  44.64 
 
 		 221 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  38.18 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
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NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 229 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
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NC_010557  BamMC406_6291  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.170422  normal  0.0225355 
 
 
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NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 257 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
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NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
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NC_008392  Bamb_6577  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_46570  putative transcriptional regulator  48.08 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161907  hitchhiker  0.00000116969 
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 210 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
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NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
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NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 324 aa  52.8  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  44.64 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  32.58 
 
 		 278 aa  52.4  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0414  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 220 aa  52.4  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6530  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 219 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.051486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  52.17 
 
 		 184 aa  52  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2216  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 203 aa  52  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 223 aa  51.6  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 244 aa  52  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 222 aa  51.6  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 224 aa  51.6  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
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NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 209 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
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NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 189 aa  51.6  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
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NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 216 aa  51.6  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
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NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 188 aa  51.2  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 188 aa  51.2  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 188 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 188 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
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NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 188 aa  51.2  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 228 aa  51.2  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
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NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 206 aa  51.2  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
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