More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3965 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 208 aa  408  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 295 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  36.65 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2823  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133482  normal  0.0456725 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5312  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 235 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3846  regulatory protein TetR  33.85 
 
 		 193 aa  74.7  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 201 aa  72  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1459  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.568759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  36.25 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  41.84 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4839  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4927  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5714  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4581  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.19483 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 307 aa  58.2  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0321  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0346  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  42.05 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  42.59 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5095  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0948615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5183  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5474  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 438 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0960  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.462033  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3271  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377871  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  52.73 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  32.76 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  37.04 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  27.35 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  40.74 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  25.38 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1346  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1826  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 250 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0995188  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  18.89 
 
 		 184 aa  52.8  0.000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0354  hypothetical protein  46.94 
 
 		 230 aa  52.8  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0313675 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 236 aa  52.8  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4339  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00746452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0274  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.160629  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  38.36 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 236 aa  52.4  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  40.74 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2385  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 176 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000106592  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 243 aa  52.4  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  26.67 
 
 		 191 aa  52.4  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4586  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.330892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5713  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 190 aa  51.6  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3866  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 230 aa  52  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599707  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 198 aa  51.6  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  34.48 
 
 		 207 aa  51.6  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 189 aa  51.6  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 197 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 286 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8733  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153176  normal  0.242309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>