More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5474 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_5474  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 189 aa  370  1e-102  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5095  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 189 aa  370  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0948615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5183  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 189 aa  370  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5714  TetR family transcriptional regulator  77.66 
 
 		 189 aa  259  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3846  regulatory protein TetR  58.67 
 
 		 193 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10782  hypothetical protein  41.58 
 
 		 213 aa  127  9.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.882967 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5158  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 198 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1599  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 198 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4962  TetR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.643195 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4579  TetR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4667  TetR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.519146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4585  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0832555  normal  0.934265 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1722  TetR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.287966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  42.19 
 
 		 193 aa  51.2  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  33.33 
 
 		 194 aa  51.2  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0309  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.312076  normal  0.149076 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  23.46 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 224 aa  50.4  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3324  regulatory protein, TetR  36.36 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 232 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 237 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 209 aa  48.9  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 199 aa  48.5  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 211 aa  48.5  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 198 aa  48.5  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 240 aa  48.5  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 228 aa  48.5  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  28.98 
 
 		 219 aa  48.5  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 227 aa  48.1  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 207 aa  48.1  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 208 aa  48.1  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 195 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2128  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 202 aa  48.1  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.190242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 195 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0414  TetR family transcriptional regulator  19.87 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  46.6  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 230 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 252 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  26.89 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 238 aa  46.2  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  41.07 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1323  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 207 aa  45.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  47.17 
 
 		 200 aa  45.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  41.07 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3549  transcriptional regulator AefR  32.95 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.695719  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1862  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 242 aa  45.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0392  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.022112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 189 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 191 aa  45.4  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 242 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 222 aa  45.4  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19280  transcriptional regulator  28.81 
 
 		 235 aa  45.1  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.28299  normal  0.286722 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 244 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 213 aa  45.1  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 223 aa  45.1  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 195 aa  45.1  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 230 aa  45.1  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  35.96 
 
 		 221 aa  44.7  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 189 aa  44.7  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 189 aa  44.7  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2527  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 176 aa  45.1  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 214 aa  45.1  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 223 aa  45.1  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 192 aa  45.1  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  30.65 
 
 		 195 aa  44.7  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 210 aa  44.7  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 205 aa  44.7  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 191 aa  44.7  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 218 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>