71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10782 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10782  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  429  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.882967 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4962  TetR family transcriptional regulator  69.65 
 
 		 203 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.643195 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4667  TetR family transcriptional regulator  69.65 
 
 		 203 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.519146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4579  TetR family transcriptional regulator  69.65 
 
 		 203 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5158  TetR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 198 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1599  TetR family transcriptional regulator  71.35 
 
 		 198 aa  229  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5714  TetR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 189 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3846  regulatory protein TetR  41.54 
 
 		 193 aa  115  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5474  TetR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5183  TetR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5095  TetR family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0948615  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1722  TetR family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 194 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.287966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4585  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 195 aa  99.8  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0832555  normal  0.934265 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  29.13 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  30 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1311  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 241 aa  46.2  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1689  transcriptional regulator, TetR family  27.19 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0605741  hitchhiker  0.00000000000000310562 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 199 aa  45.8  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2545  transcriptional regulator, TetR family  27.19 
 
 		 201 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.91976e-46 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2354  TetR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 201 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0622512  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2312  TetR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 201 aa  45.8  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394535  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2530  TetR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 201 aa  45.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.828016  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 231 aa  45.4  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2270  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 212 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  32.39 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1626  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432632 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 186 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1320  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 232 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  26.78 
 
 		 219 aa  43.5  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  31.68 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 224 aa  42.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 324 aa  42.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  29.41 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  28.87 
 
 		 194 aa  42.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 218 aa  42.4  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 237 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 246 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 186 aa  42.4  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 226 aa  42  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 268 aa  42  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 231 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 235 aa  42  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  24.83 
 
 		 203 aa  42  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 204 aa  42  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0410  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 195 aa  42  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0114  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 220 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.621262  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  29.92 
 
 		 201 aa  41.6  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 219 aa  42  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 199 aa  41.6  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  41.6  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 235 aa  41.2  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 210 aa  41.6  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>