141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1599 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1599  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 198 aa  403  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5158  TetR family transcriptional regulator  91.92 
 
 		 198 aa  345  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4579  TetR family transcriptional regulator  78.79 
 
 		 203 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4667  TetR family transcriptional regulator  78.79 
 
 		 203 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.519146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4962  TetR family transcriptional regulator  78.79 
 
 		 203 aa  286  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.643195 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10782  hypothetical protein  71.35 
 
 		 213 aa  253  9e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.882967 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3846  regulatory protein TetR  42.35 
 
 		 193 aa  122  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5714  TetR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 189 aa  121  7e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5095  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0948615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5183  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5474  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1722  TetR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.287966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4585  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 195 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0832555  normal  0.934265 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  28.73 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  31.4 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13075  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 226 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.576817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2679  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 233 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4635  regulatory protein, TetR  28.68 
 
 		 226 aa  51.6  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1809  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1856  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1790  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 211 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.305772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0595  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 218 aa  48.5  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1262  hypothetical protein  36.76 
 
 		 233 aa  48.1  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.683399  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2323  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.169023  normal  0.0173664 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  28.12 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  25.25 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2032  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44645  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0114  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.621262  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  20.53 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3925  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.376299  normal  0.034998 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 208 aa  45.4  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 237 aa  45.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4615  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 225 aa  45.4  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 195 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 243 aa  45.4  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  34.26 
 
 		 204 aa  45.1  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 199 aa  44.7  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1311  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 241 aa  45.1  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 191 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0743  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.803231 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04290  transcriptional regulator  29.27 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0356089  normal  0.115644 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 218 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 218 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5312  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 235 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 218 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1459  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.568759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0410  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 232 aa  44.7  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0040  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3571  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1705  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164694  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 221 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3613  regulatory protein, TetR  32.43 
 
 		 243 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4541  regulatory protein, TetR  31.76 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0842313  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 208 aa  42.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3581  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 226 aa  42.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  26.87 
 
 		 199 aa  43.1  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 217 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 190 aa  43.1  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 191 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>