143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5158 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5158  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 198 aa  401  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1599  TetR family transcriptional regulator  91.92 
 
 		 198 aa  345  2e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4579  TetR family transcriptional regulator  77.78 
 
 		 203 aa  283  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4667  TetR family transcriptional regulator  77.78 
 
 		 203 aa  283  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.519146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4962  TetR family transcriptional regulator  77.78 
 
 		 203 aa  283  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.643195 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10782  hypothetical protein  66.67 
 
 		 213 aa  255  3e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.882967 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5714  TetR family transcriptional regulator  45.14 
 
 		 189 aa  120  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3846  regulatory protein TetR  41.18 
 
 		 193 aa  119  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5095  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0948615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5183  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5474  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1722  TetR family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 194 aa  107  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.287966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4585  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 195 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0832555  normal  0.934265 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  28.16 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  33.06 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13075  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.576817 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2679  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 233 aa  52  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 237 aa  51.2  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 227 aa  50.4  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1262  hypothetical protein  38.16 
 
 		 233 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.683399  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4635  regulatory protein, TetR  27.94 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  29.17 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 219 aa  48.5  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0595  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 218 aa  48.1  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  35.56 
 
 		 204 aa  48.1  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0040  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2323  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.169023  normal  0.0173664 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  26.67 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3925  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.376299  normal  0.034998 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0114  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.621262  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1311  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 241 aa  46.6  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  19.87 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  37.5 
 
 		 202 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 203 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1809  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 211 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1856  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 211 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2032  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 213 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44645  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1790  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 211 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.305772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1705  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 203 aa  45.1  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164694  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 218 aa  45.1  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 243 aa  45.1  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 232 aa  44.7  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 204 aa  44.7  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3571  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 227 aa  44.3  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  26.2 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2740  TetR family transcriptional regulator  21.59 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0291953  hitchhiker  0.000390237 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0743  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.803231 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 218 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 218 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 218 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1459  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 223 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.568759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4384  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 295 aa  43.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 249 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 200 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0410  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>