More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3846 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3846  regulatory protein TetR  100 
 
 		 193 aa  389  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5095  TetR family transcriptional regulator  58.67 
 
 		 189 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0948615  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5183  TetR family transcriptional regulator  58.67 
 
 		 189 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5474  TetR family transcriptional regulator  58.67 
 
 		 189 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5714  TetR family transcriptional regulator  56.28 
 
 		 189 aa  177  9e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10782  hypothetical protein  41.54 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.882967 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1599  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 198 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5158  TetR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4579  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4667  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.519146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4962  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.643195 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4585  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0832555  normal  0.934265 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1722  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.287966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0324  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.867461  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0334  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.611067  normal  0.230945 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 223 aa  53.1  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0313  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 201 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 210 aa  51.2  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 220 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 242 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 203 aa  49.3  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 203 aa  49.3  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 243 aa  49.3  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 242 aa  48.9  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 209 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 209 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  34.55 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2128  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.190242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 227 aa  48.9  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0416  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 228 aa  48.5  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0414  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 233 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 200 aa  48.1  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2710  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 231 aa  47.8  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 212 aa  47.8  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 214 aa  48.1  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4603  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 240 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.488249 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  23.98 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32940  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1059  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04290  transcriptional regulator  36.07 
 
 		 230 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0356089  normal  0.115644 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0726  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.892311  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2823  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133482  normal  0.0456725 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.87 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4015  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 239 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 190 aa  45.8  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4579  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 230 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1382  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 241 aa  46.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0100297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0066  transcriptional regulator  31.15 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0323  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 227 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.939407  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4584  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 230 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 221 aa  45.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  26.37 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0042  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664551  normal  0.814156 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  25.2 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1382  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 217 aa  45.4  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 190 aa  45.4  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 236 aa  45.4  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0591  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 226 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3949  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0865952  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 202 aa  45.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 228 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06680  transcriptional regulator  41.51 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 202 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 250 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 195 aa  45.1  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 193 aa  45.1  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 224 aa  45.1  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 201 aa  45.1  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3996  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 228 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.624951  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  27.12 
 
 		 195 aa  45.1  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 229 aa  45.1  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4070  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 228 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3415  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 209 aa  45.1  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 191 aa  44.7  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 218 aa  44.7  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 211 aa  44.7  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 208 aa  44.7  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 208 aa  44.7  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 213 aa  44.7  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 200 aa  44.7  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>