More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1059 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1059  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 188 aa  383  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1769  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 198 aa  158  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 194 aa  123  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3666  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3253  transcriptional regulator  30.85 
 
 		 194 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0516477  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2575  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 196 aa  88.6  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.230257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3194  transcriptional regulator, TetR family  24.46 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  27.06 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3723  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000134359  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3515  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000109065  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  22.51 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  23.68 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0730  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 207 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  24.32 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  24.32 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 231 aa  54.3  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 207 aa  54.3  0.0000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0053  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.573004  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 223 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 222 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  23.4 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4681  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  23.3 
 
 		 219 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 253 aa  51.2  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0291  TetR family transcriptional regulator  21.84 
 
 		 205 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 199 aa  50.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  30 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 218 aa  49.3  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 228 aa  49.3  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1196  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 235 aa  48.9  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270816  normal  0.528782 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  20.11 
 
 		 254 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 195 aa  48.5  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  30.11 
 
 		 186 aa  48.5  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  23.33 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2538  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000716  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 175 aa  48.5  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.421465  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2489  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 203 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.371609  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  22.96 
 
 		 211 aa  48.1  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  22.96 
 
 		 211 aa  48.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  22.41 
 
 		 201 aa  48.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 228 aa  48.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 194 aa  48.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  20.65 
 
 		 209 aa  48.1  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  22.96 
 
 		 211 aa  48.1  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  22.96 
 
 		 211 aa  48.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  22.96 
 
 		 211 aa  48.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  22.96 
 
 		 211 aa  48.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  22.96 
 
 		 211 aa  48.1  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 213 aa  48.1  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 237 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2071  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 206 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 211 aa  47.8  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 189 aa  47.8  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 200 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5412  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00435132  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1526  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 200 aa  47  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1997  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0474929  normal  0.0514197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>