191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2538 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2538  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000716  transcriptional regulator  32.11 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.421465  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 204 aa  51.6  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 183 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 218 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4953  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281079  normal  0.71404 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 199 aa  48.9  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1059  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 174 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1520  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 207 aa  48.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 193 aa  48.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 204 aa  48.1  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 193 aa  48.1  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0439  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 226 aa  47.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  34.95 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2600  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0458  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13864  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2654  regulatory protein TetR  26.92 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  25.96 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  22.98 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  35.71 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  40.74 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0392  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.022112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3058  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000151008  decreased coverage  0.0000000705144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7123  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 200 aa  45.1  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 207 aa  45.1  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 225 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 203 aa  45.1  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  33.33 
 
 		 198 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1676  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 201 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  30.38 
 
 		 190 aa  45.1  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 237 aa  44.7  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 192 aa  44.7  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0046  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 198 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 186 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 255 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0374  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.120665  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  25 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 234 aa  43.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  35.48 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1583  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  20 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 220 aa  43.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03670  transcriptional regulator  34.55 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00912022  hitchhiker  0.0085588 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5390  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4593  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10871  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4889  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 198 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>