More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1997 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1997  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  400  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0474929  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2689  putative transcriptional regulator, TetR family  47.2 
 
 		 325 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.559134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0691  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.545949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8662  transcriptional regulator, TetR family  41.13 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  38.58 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1039  TetR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3693  regulatory protein TetR  40.71 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000370458  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1169  regulatory protein, TetR  45.83 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2744  TetR family transcriptional regulator  44.8 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2788  TetR family transcriptional regulator  44.8 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2774  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.783627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  36.57 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9036  putative transcriptional regulator, TetR family  35.66 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.505167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1382  transcriptional regulator, TetR family  39.45 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0100297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2613  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.443179 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2572  regulatory protein TetR  33.59 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3010  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 233 aa  55.5  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  52.63 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  48.44 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  51.02 
 
 		 264 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1520  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2595  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000390458  hitchhiker  0.00180541 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 214 aa  52.4  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  56.25 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 273 aa  52  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 206 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 208 aa  52  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 216 aa  51.6  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6309  putative transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 197 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407991  normal  0.0813971 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 216 aa  51.6  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3620  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 203 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3745  hypothetical protein  33.94 
 
 		 240 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239031  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4295  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1574  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00597987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  36.78 
 
 		 390 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 252 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3698  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1777  regulatory protein, TetR  41.27 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.26768  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  51.06 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3827  putative transcriptional regulator  44.64 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 266 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 271 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  27.91 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 275 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44980  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 256 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  41.07 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1600  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0652187  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 278 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 278 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 400 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 278 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  44.68 
 
 		 251 aa  49.7  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 239 aa  49.3  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  35.82 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 226 aa  49.7  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>