More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2689 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2689  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 325 aa  637    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.559134 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0691  TetR family transcriptional regulator  66.82 
 
 		 218 aa  252  6e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.545949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9036  putative transcriptional regulator, TetR family  38.42 
 
 		 214 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.505167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8662  transcriptional regulator, TetR family  37.56 
 
 		 207 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2744  TetR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 214 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2788  TetR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 214 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 220 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2774  TetR family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 214 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.783627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 209 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 222 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3010  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 218 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 210 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1997  TetR family transcriptional regulator  47.2 
 
 		 209 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0474929  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2572  regulatory protein TetR  31.86 
 
 		 238 aa  99.8  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1169  regulatory protein, TetR  34.42 
 
 		 225 aa  96.7  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1039  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 223 aa  95.9  8e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1382  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 241 aa  94.7  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0100297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2613  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 212 aa  94.7  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.443179 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3693  regulatory protein TetR  31.6 
 
 		 216 aa  92.4  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000370458  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3745  hypothetical protein  32.23 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239031  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3160  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1030  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5762  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182054  normal  0.0696367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4233  transcriptional regulator, TetR family  42.7 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0221768  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2595  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000390458  hitchhiker  0.00180541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4551  regulatory protein TetR  29.38 
 
 		 217 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  26.77 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  40.91 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1245  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 196 aa  55.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  39.51 
 
 		 216 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1087  TetR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 222 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00014413  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  18.44 
 
 		 201 aa  55.1  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 208 aa  53.5  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 214 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 207 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 207 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 207 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  50 
 
 		 199 aa  53.1  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 224 aa  53.1  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4295  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 203 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1574  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 203 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00597987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3620  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 203 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 203 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 212 aa  52.8  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 222 aa  52.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 202 aa  52.8  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 247 aa  52.8  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 255 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 217 aa  52.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 198 aa  52.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18080  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 212 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 216 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1569  putative transcriptional regulator  47.62 
 
 		 212 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  40.26 
 
 		 264 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 217 aa  51.6  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1600  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 201 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0652187  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 256 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 206 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 206 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 206 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 193 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 216 aa  51.2  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2071  TetR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 206 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.51999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 216 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 216 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  43.9 
 
 		 204 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  27.05 
 
 		 208 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 214 aa  51.2  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 212 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 247 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3698  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 202 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1777  regulatory protein, TetR  40.91 
 
 		 202 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.26768  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 202 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 205 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 		 309 aa  50.4  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0296  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 216 aa  50.4  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 208 aa  50.4  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 205 aa  50.1  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35810  Regulatory protein, TetR-family  27.6 
 
 		 183 aa  50.1  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1799  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 196 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0120  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 227 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.555065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 197 aa  50.1  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 211 aa  50.1  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 187 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 205 aa  49.7  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 273 aa  49.7  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1641  transcriptional regulator, TetR family protein  34.21 
 
 		 145 aa  49.7  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.216203  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  46.05 
 
 		 203 aa  49.7  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  30 
 
 		 209 aa  49.7  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0085  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 195 aa  49.7  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  0.0000722764 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 193 aa  49.7  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0764  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 204 aa  49.7  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000222329 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7468  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 218 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23471  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 213 aa  49.3  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4202  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 204 aa  49.3  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 212 aa  49.3  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>