More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4202 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4202  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 204 aa  387  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4233  transcriptional regulator, TetR family  46.27 
 
 		 200 aa  141  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0221768  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2689  putative transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 325 aa  78.6  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.559134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9036  putative transcriptional regulator, TetR family  47.95 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.505167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3160  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1382  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0100297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  38.05 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3010  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  43.9 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0691  TetR family transcriptional regulator  51.95 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.545949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  39.5 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8662  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1997  TetR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0474929  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4042  transcriptional regulator, TetR family  49.25 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.229679  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3745  hypothetical protein  51.61 
 
 		 240 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239031  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2613  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 212 aa  51.6  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.443179 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  27.34 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  27.34 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  27.34 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5762  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 204 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182054  normal  0.0696367 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 223 aa  51.6  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  27.34 
 
 		 195 aa  52  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  27.34 
 
 		 195 aa  52  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 217 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 226 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18080  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 212 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1569  putative transcriptional regulator  29.93 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0708  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0296  transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 263 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1030  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3809  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3693  regulatory protein TetR  37.82 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000370458  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 216 aa  48.5  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 216 aa  48.5  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 256 aa  48.5  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 217 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  45.59 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 216 aa  48.5  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 200 aa  48.5  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 220 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 200 aa  48.1  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6844  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 203 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 309 aa  48.1  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  32.05 
 
 		 195 aa  48.1  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 219 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6309  putative transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407991  normal  0.0813971 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 270 aa  47.8  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  39.25 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 257 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 234 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>