More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1030 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1030  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 220 aa  439  9.999999999999999e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3010  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9036  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.505167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3693  regulatory protein TetR  33.65 
 
 		 216 aa  90.9  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000370458  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8662  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 207 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3745  hypothetical protein  34.12 
 
 		 240 aa  89  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239031  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 210 aa  88.2  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2689  putative transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 325 aa  84.7  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.559134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0296  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2613  transcriptional regulator, TetR family  25.24 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.443179 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 222 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2744  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2788  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1382  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0100297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2774  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.783627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4042  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.229679  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2572  regulatory protein TetR  26.54 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5762  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182054  normal  0.0696367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3160  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0691  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.545949 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2595  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000390458  hitchhiker  0.00180541 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1169  regulatory protein, TetR  29.52 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2237  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 261 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1039  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1382  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 204 aa  52.4  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 213 aa  52  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4233  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 200 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0221768  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5224  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 207 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  34.03 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4551  regulatory protein TetR  30.65 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.46 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.46 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  38.46 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003766  predicted transcriptional regulator for fatty acid degradation FadQ TetR family  26.87 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 211 aa  49.7  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  40.62 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  27.07 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 219 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  27.07 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  27.07 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  27.07 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  27.07 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  27.07 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1997  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0474929  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  36.36 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1447  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 214 aa  48.9  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.268108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 210 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 217 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 204 aa  48.5  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  34.96 
 
 		 207 aa  48.5  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 242 aa  48.5  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 223 aa  48.5  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 218 aa  48.5  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 223 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  34.31 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18820  transcriptional regulator  31.91 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348199  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>