More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0691 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0691  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  430  1e-120  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.545949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2689  putative transcriptional regulator, TetR family  66.82 
 
 		 325 aa  284  8e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.559134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3010  TetR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 218 aa  135  5e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9036  putative transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 214 aa  121  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.505167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8662  transcriptional regulator, TetR family  38.07 
 
 		 207 aa  115  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2744  TetR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2788  TetR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  37.38 
 
 		 210 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 220 aa  112  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1997  TetR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 209 aa  109  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0474929  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1039  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 223 aa  108  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2774  TetR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.783627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2572  regulatory protein TetR  33.49 
 
 		 238 aa  104  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3693  regulatory protein TetR  34.45 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000370458  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2613  transcriptional regulator, TetR family  33.84 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.443179 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1382  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 241 aa  102  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0100297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1169  regulatory protein, TetR  36.62 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3745  hypothetical protein  34.12 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239031  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5762  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182054  normal  0.0696367 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2595  transcriptional regulator, TetR family  32.55 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000390458  hitchhiker  0.00180541 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3160  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1030  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4233  transcriptional regulator, TetR family  41.57 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0221768  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 256 aa  61.6  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  53.12 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  42.17 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3698  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4295  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1574  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00597987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3620  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1569  putative transcriptional regulator  46.67 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18080  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1777  regulatory protein, TetR  33.67 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.26768  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1600  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0652187  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0084  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.382504  normal  0.519853 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0296  transcriptional regulator, TetR family  33.49 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4551  regulatory protein TetR  28.84 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  41.89 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0833  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0851  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.45674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  47.69 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4202  transcriptional regulator, TetR family  53.52 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 273 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1087  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00014413  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0160  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  42.53 
 
 		 326 aa  53.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  40.86 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  39.24 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  39.24 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  27.94 
 
 		 227 aa  52.8  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  17.13 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  39.24 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  39.24 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  39.24 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  39.24 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>