247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2774 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2774  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  420  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.783627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2744  TetR family transcriptional regulator  96.73 
 
 		 214 aa  384  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2788  TetR family transcriptional regulator  96.73 
 
 		 214 aa  384  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9036  putative transcriptional regulator, TetR family  41.55 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.505167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2689  putative transcriptional regulator, TetR family  41.29 
 
 		 325 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.559134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8662  transcriptional regulator, TetR family  39.2 
 
 		 207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  36.28 
 
 		 210 aa  111  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2572  regulatory protein TetR  34.42 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1169  regulatory protein, TetR  36.89 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0691  TetR family transcriptional regulator  39.41 
 
 		 218 aa  101  8e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.545949 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 220 aa  98.6  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3745  hypothetical protein  38.21 
 
 		 240 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239031  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 209 aa  96.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2613  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.443179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3010  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 218 aa  89  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5762  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 204 aa  88.6  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182054  normal  0.0696367 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1039  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 223 aa  86.7  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3160  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 212 aa  84.7  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1997  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0474929  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0296  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3693  regulatory protein TetR  35.12 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000370458  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1382  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 241 aa  79  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0100297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1030  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4042  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.229679  normal  0.106608 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  30.66 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4233  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0221768  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3134  hypothetical protein  30.14 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.744862  hitchhiker  0.000170906 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4551  regulatory protein TetR  31.19 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2595  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000390458  hitchhiker  0.00180541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6337  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 242 aa  52.4  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 200 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 239 aa  51.6  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 216 aa  51.6  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 200 aa  51.6  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  51.67 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4202  transcriptional regulator, TetR family  52.11 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.96 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  58.7 
 
 		 233 aa  49.3  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 208 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 209 aa  48.5  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.71 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38380  putative transcriptional regulator  40.79 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0126427 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2516  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 200 aa  46.2  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1594  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000148614  unclonable  0.000000209189 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 222 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 248 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0291  putative transcriptional regulator, TetR family  44.59 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3066  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 229 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 470 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 204 aa  45.8  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18820  transcriptional regulator  43.33 
 
 		 225 aa  45.4  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348199  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2354  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 184 aa  45.4  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  22.78 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5376  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 445 aa  45.4  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 237 aa  45.4  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3383  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 197 aa  45.1  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.606536  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 202 aa  45.1  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5092  putative transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 206 aa  45.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318569  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 412 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 199 aa  45.1  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 206 aa  45.1  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  38.71 
 
 		 227 aa  45.1  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6809  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 178 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.318139  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2237  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 412 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5550  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>