More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0815 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 207 aa  409  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  42.23 
 
 		 204 aa  136  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  51.7 
 
 		 209 aa  131  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1892  TetR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000800916  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1272  transcriptional regulator, TetR family  40.12 
 
 		 176 aa  92  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 205 aa  89.4  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5134  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 198 aa  87.8  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5223  TetR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 195 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5515  TetR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 195 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 218 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  36.36 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 257 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  43 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 202 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4953  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281079  normal  0.71404 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 220 aa  71.2  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  36.29 
 
 		 208 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  38.66 
 
 		 214 aa  68.9  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  34.1 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 264 aa  68.2  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  29.41 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
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NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  32.66 
 
 		 241 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.86361 
 
 
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NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 219 aa  65.1  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  38.46 
 
 		 200 aa  64.7  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
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NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  50.77 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
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NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  50.77 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  29.56 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  33.08 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3393  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158575  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  45.07 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  33.79 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 225 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 221 aa  62  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 226 aa  62  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0969  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 216 aa  62  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 217 aa  62  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.939945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  33.81 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5445  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5417  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.618934  decreased coverage  0.00324744 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 269 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0612  transcriptional regulator, TetR family  25.51 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6881  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0734971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
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NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
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NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  40.4 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
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NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013947  Snas_0566  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
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NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 74 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_3710  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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