More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0300 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
214 aa  426  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 
239 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  48.39 
 
 
225 aa  90.1  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  51.76 
 
 
208 aa  88.6  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  65.67 
 
 
74 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  60.29 
 
 
203 aa  81.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  60.29 
 
 
203 aa  81.3  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  52.5 
 
 
205 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  53.25 
 
 
213 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  61.9 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 
218 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  62.71 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  60 
 
 
216 aa  79  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  60.94 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  41.84 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  62.71 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
229 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  43.56 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 
222 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  33.49 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  62.71 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  58.46 
 
 
214 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  48.35 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  62.71 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.939945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 
209 aa  75.5  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  66.1 
 
 
213 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
218 aa  75.5  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  37.62 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
257 aa  75.1  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  37.04 
 
 
264 aa  74.3  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  51.39 
 
 
242 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  50.77 
 
 
198 aa  74.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  43 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  47.25 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  47.25 
 
 
209 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  43.68 
 
 
208 aa  74.3  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 
222 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  55.22 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  48.86 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  47.22 
 
 
208 aa  72.8  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  62.71 
 
 
219 aa  72.8  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5445  TetR family transcriptional regulator  59.32 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5417  TetR family transcriptional regulator  59.32 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.618934  decreased coverage  0.00324744 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  59.32 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  61.02 
 
 
243 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  42.27 
 
 
219 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  48.65 
 
 
217 aa  72  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  47.3 
 
 
199 aa  71.2  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 
205 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  46.48 
 
 
204 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0121  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
207 aa  66.6  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1272  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388296  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3393  TetR family transcriptional regulator  54.24 
 
 
263 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158575  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 
203 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 
203 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5773  transcriptional regulator TetR family  38.96 
 
 
208 aa  62.8  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  36.84 
 
 
200 aa  62.8  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
222 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5134  TetR family transcriptional regulator  45.33 
 
 
198 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 
227 aa  62.4  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5223  TetR family transcriptional regulator  45.33 
 
 
195 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5515  TetR family transcriptional regulator  45.33 
 
 
195 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3816  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 
231 aa  61.6  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 
223 aa  61.6  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3297  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
232 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
205 aa  61.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1996  regulatory protein TetR  51.72 
 
 
215 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 
218 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0118  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.980303  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 
218 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 
224 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 
218 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 
201 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
217 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  30.87 
 
 
245 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
216 aa  58.9  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 
218 aa  58.2  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.440249 
 
 
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NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 
236 aa  58.2  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal 
 
 
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NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
209 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
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NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal 
 
 
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NC_013161  Cyan8802_0857  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 
218 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.999415 
 
 
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NC_011726  PCC8801_0829  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 
218 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 
195 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.607466 
 
 
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NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 
229 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0359606 
 
 
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NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
220 aa  56.6  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 
196 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
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NC_013510  Tcur_4772  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 
184 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
210 aa  56.2  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  40.54 
 
 
258 aa  55.5  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
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NC_011981  Avi_7032  transcriptional regulator TetR family  42.37 
 
 
215 aa  55.1  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 
223 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
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