More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2011 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
203 aa  397  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
203 aa  397  9.999999999999999e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  52.5 
 
 
202 aa  169  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  52.02 
 
 
209 aa  168  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  52.02 
 
 
209 aa  168  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  53.27 
 
 
209 aa  167  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  52.58 
 
 
208 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  45.36 
 
 
213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 
214 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  48.46 
 
 
209 aa  95.5  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  36.23 
 
 
225 aa  93.6  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  44.25 
 
 
208 aa  89  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  47.67 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  60.29 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
218 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  41.55 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  52.24 
 
 
220 aa  79  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  61.54 
 
 
205 aa  78.6  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 
257 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  39.41 
 
 
213 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  44.25 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  48.19 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 
204 aa  76.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  49.33 
 
 
218 aa  75.5  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  55 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  52.86 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  46.07 
 
 
198 aa  74.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  42.48 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  56.06 
 
 
74 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
210 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.939945 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  59.68 
 
 
210 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  58.06 
 
 
210 aa  71.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  62.71 
 
 
216 aa  71.2  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  37.12 
 
 
264 aa  70.9  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  39.09 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  53.03 
 
 
229 aa  71.2  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  35.29 
 
 
212 aa  70.1  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
225 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7032  transcriptional regulator TetR family  32.33 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5303  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.444335 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  51.95 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  63.64 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  63.64 
 
 
205 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  56.45 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
218 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5445  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
225 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5417  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 
225 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.618934  decreased coverage  0.00324744 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  37.27 
 
 
201 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  34.69 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  49.23 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  33.81 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3393  TetR family transcriptional regulator  57.63 
 
 
263 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158575  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  52.31 
 
 
227 aa  65.1  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1272  transcriptional regulator, TetR family  62.26 
 
 
176 aa  65.1  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388296  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  47.69 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  50.77 
 
 
207 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 
218 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5134  TetR family transcriptional regulator  59.26 
 
 
198 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5515  TetR family transcriptional regulator  59.26 
 
 
195 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5223  TetR family transcriptional regulator  59.26 
 
 
195 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
208 aa  62  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  41.98 
 
 
210 aa  61.6  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 
223 aa  61.6  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
236 aa  61.6  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  39 
 
 
195 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  45.59 
 
 
258 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6770  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 
220 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  48.57 
 
 
205 aa  60.1  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6881  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
224 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0734971  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0249  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
238 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1551  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
221 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6278  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
221 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185779  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5773  transcriptional regulator TetR family  40.91 
 
 
208 aa  59.7  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 
218 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 
217 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 
217 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal 
 
 
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NC_013441  Gbro_1996  regulatory protein TetR  44.93 
 
 
215 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 
218 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal 
 
 
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NC_007519  Dde_1892  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 
192 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000800916  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
220 aa  55.8  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
222 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 
218 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal 
 
 
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NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
222 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 
218 aa  55.5  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
200 aa  55.5  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal 
 
 
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NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  30.87 
 
 
247 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0783886 
 
 
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NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
216 aa  53.9  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
209 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
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NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 
245 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal 
 
 
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NC_013510  Tcur_4772  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 
184 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009338  Mflv_4953  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 
184 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281079  normal  0.71404 
 
 
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NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  32.38 
 
 
209 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
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NC_008347  Mmar10_1981  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 
217 aa  53.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.992174  normal 
 
 
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