More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1901 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 245 aa  500  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  73.62 
 
 		 236 aa  357  9.999999999999999e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 229 aa  85.1  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 217 aa  85.1  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  34.03 
 
 		 264 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  28.44 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1996  regulatory protein TetR  27.09 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 203 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  33.87 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  36.45 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 209 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  34.82 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4025  regulatory protein, TetR  39.81 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0566  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 193 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 205 aa  65.1  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4772  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5515  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5134  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5223  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0857  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.999415 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0829  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6770  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 198 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1551  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6278  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 221 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7032  transcriptional regulator TetR family  29.6 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  41.1 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2679  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6881  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0734971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 213 aa  53.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5007  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 239 aa  53.9  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 209 aa  53.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 205 aa  53.1  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 199 aa  53.1  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 208 aa  52.8  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 214 aa  52.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  39.36 
 
 		 238 aa  52.4  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 247 aa  52.4  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 247 aa  52.4  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0532  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 207 aa  52  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0875801  normal  0.0277044 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2301  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0249  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 238 aa  51.6  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1272  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 176 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 201 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2043  TetR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1892  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 192 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000800916  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3393  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 263 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158575  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 211 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0204  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 191 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  41.54 
 
 		 216 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 210 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 192 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>