164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4772 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4772  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 184 aa  371  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  63.54 
 
 		 229 aa  234  7e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  61.8 
 
 		 196 aa  231  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  63.84 
 
 		 215 aa  225  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  56.04 
 
 		 223 aa  212  1.9999999999999998e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4025  regulatory protein, TetR  55.49 
 
 		 197 aa  211  7e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  55.93 
 
 		 264 aa  205  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  51.93 
 
 		 210 aa  188  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0566  transcriptional regulator, TetR family  50.28 
 
 		 193 aa  186  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  52.78 
 
 		 212 aa  182  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  52.36 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 218 aa  160  9e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  47.64 
 
 		 218 aa  156  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  49.72 
 
 		 195 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 201 aa  124  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 217 aa  67.8  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 207 aa  67.8  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  29.78 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1996  regulatory protein TetR  27.53 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5134  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5223  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5515  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 236 aa  54.7  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2249  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.672555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1770  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 203 aa  52.4  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 208 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  44.26 
 
 		 222 aa  52  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 208 aa  52  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 208 aa  51.6  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 218 aa  52  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 242 aa  51.6  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 215 aa  51.2  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0242  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 210 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0183309 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0960  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 206 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.462033  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  56.41 
 
 		 219 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 214 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0857  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.999415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  26.13 
 
 		 229 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0829  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 199 aa  50.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1272  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.388296  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  37.68 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  56.41 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1564  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  30.71 
 
 		 216 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 203 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  48.84 
 
 		 214 aa  48.5  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 213 aa  48.1  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 220 aa  48.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4356  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 210 aa  47.8  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2179  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 210 aa  48.1  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.277045 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0437  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 213 aa  47.8  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1892  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000800916  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0257  TetR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0562904  normal  0.0230468 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0385  transcriptional regulator AguR  22.65 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1821  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 212 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 216 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0481  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 239 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.510186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  43.14 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 264 aa  45.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 210 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4953  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 184 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281079  normal  0.71404 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  44.19 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 213 aa  45.1  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 192 aa  45.1  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 206 aa  45.1  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 219 aa  45.1  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6881  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 224 aa  44.7  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0734971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 208 aa  44.7  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 188 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 188 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4968  transcriptional regulator, TetR family domain protein  28.18 
 
 		 197 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 237 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>