More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2179 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2179  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  411  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.277045 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1770  transcriptional regulator, TetR family  57.35 
 
 		 203 aa  199  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  48.69 
 
 		 208 aa  165  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0857  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.999415 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0829  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  29.59 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 207 aa  62  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  39 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  34.74 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 188 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0566  transcriptional regulator, TetR family  40.48 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4772  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13440  transcriptional regulator  42.53 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0705  regulatory protein, TetR  48.28 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  40.24 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1551  transcription regulator protein  31.43 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000200418  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  36.36 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4025  regulatory protein, TetR  44.26 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0960  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.462033  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  33.75 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3995  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 191 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 245 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4028  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 228 aa  52  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21800  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 265 aa  52  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.391718  normal  0.223847 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0159  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 232 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3954  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 232 aa  51.6  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 198 aa  51.6  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1892  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 192 aa  51.6  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000800916  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 192 aa  51.6  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  48.94 
 
 		 251 aa  51.6  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 253 aa  51.6  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 247 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2969  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3030  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0097  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4802  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386552  normal  0.120275 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4927  TetR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>