More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1821 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1821  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
212 aa  422  1e-117  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  44.39 
 
 
220 aa  166  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
213 aa  137  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3782  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 
225 aa  82.4  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.608196 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  39.64 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 
211 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
201 aa  64.3  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 
201 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
210 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
324 aa  62.8  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
213 aa  61.2  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 
219 aa  60.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
195 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
195 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
195 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 
208 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
190 aa  59.7  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0667  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 
214 aa  59.7  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 
233 aa  60.1  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
287 aa  59.3  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
208 aa  58.9  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
212 aa  58.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  31.39 
 
 
225 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 
201 aa  58.2  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 
184 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
204 aa  57.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
190 aa  57.8  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05640  transcriptional regulator  37.35 
 
 
223 aa  57  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.950785  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
218 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1526  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 
189 aa  57  0.0000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2515  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 
238 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.745235  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 
214 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
215 aa  56.6  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 
209 aa  56.6  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
202 aa  56.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 
216 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0588  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
276 aa  56.6  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
220 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  41.98 
 
 
217 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
184 aa  55.8  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 
216 aa  55.8  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
214 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 
226 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0510  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
222 aa  55.5  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.673095  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 
218 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
201 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 
207 aa  55.5  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 
212 aa  55.5  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
238 aa  55.1  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
211 aa  55.5  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 
208 aa  55.1  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
205 aa  55.5  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  34.52 
 
 
230 aa  55.1  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3161  TetR family transcriptional regulator  34.96 
 
 
195 aa  55.1  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
212 aa  55.1  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
201 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  46.77 
 
 
205 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
206 aa  55.1  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
203 aa  54.7  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  46.77 
 
 
207 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 
234 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 
203 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 
226 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 
208 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  35.61 
 
 
206 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  26.4 
 
 
205 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 
218 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
211 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 
204 aa  54.7  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3710  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
213 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 
197 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 
215 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
218 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0566  transcription regulator protein  31.76 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000411686  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 
222 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  27.2 
 
 
190 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
204 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 
226 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
244 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  27.04 
 
 
190 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 
233 aa  53.1  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 
221 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
216 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
224 aa  53.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
206 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4031  DNA-binding transcriptional repressor FabR  30.09 
 
 
199 aa  53.1  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
218 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2488  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 
215 aa  53.5  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.930531  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2181  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 
189 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000940073  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
210 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
230 aa  52.4  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 
226 aa  52.8  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
195 aa  52.8  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 
219 aa  52.8  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 
195 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>