More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2597 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 195 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  49.52 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  45.23 
 
 		 212 aa  160  8.000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  48.7 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  47.87 
 
 		 218 aa  157  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  44.23 
 
 		 264 aa  152  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  43.63 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4772  transcriptional regulator, TetR family  49.72 
 
 		 184 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  41.58 
 
 		 210 aa  143  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  42.64 
 
 		 196 aa  138  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0566  transcriptional regulator, TetR family  42.02 
 
 		 193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4025  regulatory protein, TetR  42.78 
 
 		 197 aa  127  9.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 217 aa  92.4  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 201 aa  92.4  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 227 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 203 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  36.68 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1996  regulatory protein TetR  29.8 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0829  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0857  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.999415 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  34.82 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  39 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  39 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1770  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1981  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.992174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  45.12 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 218 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 218 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1459  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.568759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 218 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5312  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 235 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5773  transcriptional regulator TetR family  35.8 
 
 		 208 aa  52  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 195 aa  51.6  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 247 aa  51.2  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0133  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 218 aa  51.2  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.440249 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  35.82 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 295 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 264 aa  50.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  31.43 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  38.75 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  31.43 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  26.87 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6881  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 224 aa  49.3  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0734971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2179  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.277045 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2823  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133482  normal  0.0456725 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6770  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 220 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 222 aa  48.9  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 212 aa  48.5  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 219 aa  48.5  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  38.71 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2679  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 233 aa  48.5  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.196743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>