More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1459 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1459  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  448  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.568759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5312  TetR family transcriptional regulator  91.91 
 
 		 235 aa  428  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  96.65 
 
 		 218 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  96.65 
 
 		 218 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  96.65 
 
 		 218 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  85.39 
 
 		 295 aa  377  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  65.26 
 
 		 219 aa  245  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2823  TetR family transcriptional regulator  65.36 
 
 		 206 aa  236  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133482  normal  0.0456725 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  63.69 
 
 		 206 aa  231  9e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  58.73 
 
 		 208 aa  221  7e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  55.61 
 
 		 201 aa  208  6e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4581  TetR family transcriptional regulator  49.44 
 
 		 223 aa  171  9e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.19483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0321  TetR family transcriptional regulator  50.56 
 
 		 223 aa  164  9e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4839  TetR family transcriptional regulator  50.57 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4927  TetR family transcriptional regulator  50.57 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4586  TetR family transcriptional regulator  47.93 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.330892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  41.85 
 
 		 212 aa  141  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0324  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 201 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.867461  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0334  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 201 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.611067  normal  0.230945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0313  TetR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 201 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0392  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 201 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.022112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3500  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.242129  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 242 aa  65.1  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  25.64 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  55.32 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3774  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6309  putative transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 197 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407991  normal  0.0813971 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6871  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.0580493 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1826  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 250 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0995188  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2583  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 226 aa  52  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 236 aa  52.4  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 229 aa  52  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 195 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1320  transcriptional regulator, TetR family  56.25 
 
 		 224 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 204 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  40.98 
 
 		 206 aa  51.6  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  31.3 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0960  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.462033  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4737  TetR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  36.19 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3995  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  36.19 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3442  TetR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.747618  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3330  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537262 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1772  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.706828  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2103  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 239 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4837  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4925  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.733021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4584  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0323  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 227 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.939407  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4579  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 230 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1609  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 239 aa  48.9  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 257 aa  48.9  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1770  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 203 aa  48.9  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 221 aa  48.9  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 209 aa  48.5  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 192 aa  48.5  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 207 aa  48.5  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 204 aa  48.5  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2869  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 192 aa  48.5  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 218 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2128  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 201 aa  48.5  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.544484  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 209 aa  48.5  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 195 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  23.65 
 
 		 195 aa  48.5  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 210 aa  48.5  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37080  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 259 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 259 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3581  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 259 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>