291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0334 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0324  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  394  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.867461  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0334  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  394  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.611067  normal  0.230945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0313  TetR family transcriptional regulator  96.02 
 
 		 201 aa  359  2e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  39.23 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 295 aa  101  9e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 218 aa  99  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 218 aa  99  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 218 aa  99  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  37.3 
 
 		 219 aa  97.8  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5312  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 235 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  35.93 
 
 		 206 aa  92  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1459  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 223 aa  92  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.568759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2823  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133482  normal  0.0456725 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4581  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 223 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.19483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0321  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 223 aa  81.6  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4839  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4927  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4586  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.330892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3330  TetR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537262 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  37.63 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3846  regulatory protein TetR  28.75 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  39.44 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0392  transcriptional regulator, TetR family  41.76 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.022112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 72 aa  50.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0726  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.892311  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0336  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 204 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153342  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0346  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.617335 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 200 aa  48.5  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0325  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 202 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.690003 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 223 aa  48.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3500  transcriptional regulator, TetR family  26.39 
 
 		 190 aa  48.1  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.242129  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  52.38 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1496  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000100434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  42.31 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34730  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.169686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 184 aa  47.4  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2965  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 175 aa  46.6  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0816  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1857  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1972  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000120212  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1105  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 253 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1005  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 244 aa  45.8  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5600  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 252 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0709  regulatory protein TetR  35.94 
 
 		 248 aa  46.2  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1661  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 252 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2296  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 252 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2273  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 252 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3547  regulatory protein, TetR  30.85 
 
 		 187 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.473445  normal  0.21056 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 184 aa  45.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4108  regulatory protein TetR  40.32 
 
 		 189 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1410  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 239 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 192 aa  45.4  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1037  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 239 aa  45.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397518  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2311  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 251 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2189  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 251 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.533648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 208 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0761  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 239 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1265  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 239 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1272  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 239 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0388  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 239 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 207 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3506  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 199 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0158634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 207 aa  45.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 212 aa  45.1  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  22.38 
 
 		 211 aa  45.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 213 aa  45.1  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2030  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 238 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0233695  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 193 aa  45.1  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 179 aa  45.1  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 210 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>