More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4586 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4586  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.330892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4581  TetR family transcriptional regulator  95.07 
 
 		 223 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.19483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0321  TetR family transcriptional regulator  93.72 
 
 		 223 aa  363  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4839  TetR family transcriptional regulator  74.65 
 
 		 223 aa  278  7e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4927  TetR family transcriptional regulator  74.65 
 
 		 223 aa  278  7e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  50.26 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  50.26 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  50.26 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  49.73 
 
 		 295 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5312  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 235 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1459  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 223 aa  174  9e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.568759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  48.07 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2823  TetR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 206 aa  142  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133482  normal  0.0456725 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  44.72 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  42.94 
 
 		 208 aa  131  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  41 
 
 		 201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 212 aa  95.9  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0313  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 201 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 213 aa  85.9  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0324  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.867461  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0334  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.611067  normal  0.230945 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  42.48 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0392  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 201 aa  72  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.022112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3500  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.242129  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  43.16 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  46.75 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  35.57 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  29.41 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  38.95 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  42.05 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3330  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537262 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2456  transcriptional regulator, TetR family  24.35 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0797268  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 184 aa  52.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  47.83 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 214 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 248 aa  52.8  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1993  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 223 aa  52.8  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  41.89 
 
 		 207 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 259 aa  52.4  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 297 aa  52  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  29.17 
 
 		 213 aa  51.6  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 193 aa  52  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  51.6  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  47.76 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 230 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 287 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5445  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 190 aa  51.6  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  36 
 
 		 193 aa  51.6  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1772  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.706828  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5417  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.618934  decreased coverage  0.00324744 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  44.87 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1826  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0995188  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4737  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  42.19 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6871  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.0580493 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 231 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  44.44 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 74 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0349  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0141  nucleoid occlusion protein  27.22 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102052  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  39.24 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 295 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1173  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  44.44 
 
 		 207 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 195 aa  49.7  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1320  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>