94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3330 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3330  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  444  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537262 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0336  TetR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 204 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153342  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0346  TetR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 202 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.617335 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3393  TetR family transcriptional regulator  48.4 
 
 		 193 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0325  TetR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 202 aa  176  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.690003 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1903  TetR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.712719  normal  0.266183 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3449  hypothetical protein  56.67 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.178666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4581  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.19483 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4927  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4839  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0313  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2823  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133482  normal  0.0456725 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0324  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.867461  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0334  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.611067  normal  0.230945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  37.62 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  37.11 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  35.64 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 295 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5312  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0321  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  41.38 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 191 aa  50.8  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 192 aa  49.3  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 217 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 217 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1025  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 214 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  0.553747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1008  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 214 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535946  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 214 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1459  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.568759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0045  transcriptional regulator  26.83 
 
 		 181 aa  46.6  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0375278  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6384  putative transcriptional regulator, TetR family  25.76 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317451  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 199 aa  45.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 214 aa  45.8  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 239 aa  45.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4586  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 223 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.330892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0392  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 201 aa  45.4  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.022112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 204 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  40.74 
 
 		 182 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 245 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2636  regulatory protein TetR  33.72 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 248 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  29.02 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0129  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0406  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 213 aa  42.7  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  45.65 
 
 		 192 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27910  transcriptional regulator, tetR family  41.51 
 
 		 194 aa  42.4  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.794272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 224 aa  42.4  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 199 aa  42.7  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1772  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 202 aa  42.4  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.706828  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0117  transcriptional regulator, putative  40.98 
 
 		 190 aa  42.4  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 249 aa  42  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4888  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 209 aa  42  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 213 aa  42  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 202 aa  42  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 212 aa  42  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 248 aa  42  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1399  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 197 aa  41.6  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.377036  hitchhiker  0.00124362 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 209 aa  41.6  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5760  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 208 aa  41.6  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.327742  normal  0.559912 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 191 aa  41.6  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 212 aa  41.6  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 226 aa  41.6  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 209 aa  41.6  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 197 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 197 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 202 aa  41.6  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 197 aa  41.6  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>