59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3393 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3393  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  381  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0325  TetR family transcriptional regulator  62.23 
 
 		 202 aa  242  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.690003 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0336  TetR family transcriptional regulator  62.23 
 
 		 204 aa  241  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153342  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0346  TetR family transcriptional regulator  62.23 
 
 		 202 aa  241  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.617335 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1903  TetR family transcriptional regulator  61.02 
 
 		 208 aa  224  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.712719  normal  0.266183 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3330  TetR family transcriptional regulator  50.57 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3449  hypothetical protein  44.12 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.178666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 224 aa  52  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 206 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 206 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 196 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 197 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 206 aa  45.1  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 203 aa  44.7  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 209 aa  43.9  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  31.03 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  35.85 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1074  transcriptional regulator, TetR family  21.05 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 242 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  39.22 
 
 		 185 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 383 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0045  transcriptional regulator  24.19 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0375278  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19500  transcriptional regulator, tetR family  33.33 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64021  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 208 aa  42.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2999  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  42.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.03228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  39.22 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2823  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 206 aa  42.4  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133482  normal  0.0456725 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 231 aa  42.7  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3882  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0630  transcriptional regulator  24.03 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 204 aa  42  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5045  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 208 aa  42  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.301448 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2301  transcriptional regulator, TetR family  19.8 
 
 		 197 aa  42  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  31.07 
 
 		 206 aa  41.6  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1310  TetR family transcriptional regulator  20.83 
 
 		 182 aa  41.2  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000104064  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  27.35 
 
 		 253 aa  41.2  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1334  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 241 aa  41.2  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 193 aa  41.2  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 237 aa  41.2  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0566  transcription regulator protein  23.15 
 
 		 207 aa  41.2  0.01  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000411686  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 192 aa  41.2  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>