61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1903 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1903  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  421  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.712719  normal  0.266183 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0336  TetR family transcriptional regulator  65.92 
 
 		 204 aa  240  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153342  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0346  TetR family transcriptional regulator  65.92 
 
 		 202 aa  240  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.617335 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0325  TetR family transcriptional regulator  65.36 
 
 		 202 aa  238  4e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.690003 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3393  TetR family transcriptional regulator  61.02 
 
 		 193 aa  224  6e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3330  TetR family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537262 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  30.51 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 206 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  23.01 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 181 aa  46.2  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1008  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 214 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1025  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 214 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  0.553747 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 208 aa  45.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  23.68 
 
 		 206 aa  45.1  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 192 aa  45.1  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4927  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4839  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8534  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.027806  hitchhiker  0.00115544 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 304 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  32.67 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2823  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133482  normal  0.0456725 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3449  hypothetical protein  31.82 
 
 		 151 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.178666  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0334  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.611067  normal  0.230945 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1262  hypothetical protein  37.04 
 
 		 233 aa  42.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.683399  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0324  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.867461  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0313  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 204 aa  42.4  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  34.07 
 
 		 185 aa  42.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5312  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 235 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 230 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  37.5 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 216 aa  42  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 194 aa  42  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 233 aa  42  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 206 aa  42  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 206 aa  42  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 215 aa  42  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1459  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 223 aa  42  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.568759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 218 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1945  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 225 aa  42  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 218 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 218 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 295 aa  41.6  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 206 aa  41.6  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 197 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 197 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 197 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 234 aa  41.6  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>