119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0325 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_0325  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.690003 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0336  TetR family transcriptional regulator  97.52 
 
 		 204 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153342  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0346  TetR family transcriptional regulator  97.52 
 
 		 202 aa  395  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.617335 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3393  TetR family transcriptional regulator  62.23 
 
 		 193 aa  242  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.708243  normal  0.761314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1903  TetR family transcriptional regulator  65.36 
 
 		 208 aa  238  4e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.712719  normal  0.266183 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3330  TetR family transcriptional regulator  47.28 
 
 		 221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537262 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5233  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.494471  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5321  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.868815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5613  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  0.405211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 383 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 239 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 214 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 206 aa  48.1  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  25.35 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0313  TetR family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0324  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.867461  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1334  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 241 aa  46.2  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0334  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.611067  normal  0.230945 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  24.41 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0630  transcriptional regulator  25.64 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 173 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2059  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 173 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.045167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 173 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 224 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  23.94 
 
 		 263 aa  45.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  33.68 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  38.33 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1892  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 192 aa  45.1  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000800916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 223 aa  45.1  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 231 aa  44.7  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 212 aa  44.7  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 201 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0048  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.567857  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2969  TetR family transcriptional regulator  20.53 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3449  hypothetical protein  31.82 
 
 		 151 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.178666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0733  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0614739  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1008  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535946  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0747  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.15327 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1025  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  0.553747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0727  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1553  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.260138 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1028  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 189 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 224 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  25.49 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  27.83 
 
 		 185 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 228 aa  43.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 245 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4754  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000397464  hitchhiker  0.00227458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 226 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 188 aa  42.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 216 aa  42.4  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 207 aa  42.4  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 212 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 223 aa  42.4  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2223  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360909  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0306  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 186 aa  42.4  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.278171  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 214 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>